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Enregistrement W7088611302 · doi:10.6084/m9.figshare.c.8083606

Distinct maternal DNA methylation associations with gestational age at early and late-mid term pregnancy in a low- and middle-income country: evaluation of biological, genetic, and psychosocial contributors

2025· other· en· W7088611302 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2025
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of OttawaCarleton UniversityBC Children's HospitalQueen's UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA methylationEpigeneticsEpigenomePregnancyFetusMicroarrayMethylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mothers undergo physiological and molecular changes over the course of gestation. These modifications “get under the skin” and may be reflected in the maternal epigenome through processes such as DNA methylation. Such an epigenetic mark may offer insights into maternal responses to prenatal influences and biological cues from the developing fetus, thereby functioning as an indirect indicator of the conditions the fetus experiences in utero. We measured whole blood DNA methylation using the MethylationEPIC BeadChip Infinium microarray v1.0 in 22 pregnant women from Pakistan, a low- and middle-income country (LMIC), at two timepoints during their term pregnancies (early: 10–19 weeks and late-mid: 22–29 weeks). We used DNA methylation profiles to predict immune cell proportions and tested differences in these proportions and DNA methylation patterns between the two timepoints. Further, we evaluated DNA methylation associations with gestational age at each timepoint and examined the contribution of genetic, psychosocial, and biological factors. Our analyses documented changes in immune cell proportions and DNA methylation profiles over the course of gestation, albeit in a small percentage of the measured DNA methylome. We also observed timepoint-specific DNA methylation associations with gestational age, predominantly at early pregnancy, with predicted interleukin-6 level and socioeconomic status contributing to a few of these associations. On comparing to three external cohorts from different sociocultural contexts, we also noted these signatures to be unique to LMIC settings. Overall, these changes measured in term pregnancies may be used to assess both fluctuations in pregnancy and birth outcomes, particular in women from LMIC settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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