Decreased Sputum Type-2 Gene Expression in COPD Current Smokers
Notice bibliographique
Résumé
Thomas Southworth,1,2 Andrew Higham,1 Augusta Beech,1,2 Jian Li,1 Sophie Wolosianka,2 Dave Singh1,2 1Division of Immunology, Immunity to Infection and Respiratory Medicine, School of Biological Sciences, Faculty of Biology, Medicine and Health, University of Manchester and Manchester University NHS Foundation Trust, Manchester, UK; 2Medicines Evaluation Unit, Manchester, UKCorrespondence: Thomas Southworth, Medicines Evaluation Unit, The Langley Building, Southmoor Road, Manchester, M23 9QZ, United Kingdom, Tel +44 161 946 4066, Email tsouthworth@meu.org.ukBackground: Higher blood eosinophil counts in COPD patients are associated with a greater response to inhaled corticosteroid (ICS) treatment, with type 2 (T2) inflammation being the target for ICS in COPD. Current smokers have reduced responses to ICS treatment. We have investigated whether current smoking modulates the levels of T2 mediators in the airways, thereby influencing ICS responsiveness.Methods: Induced sputum samples were collected from 73 COPD patients, including 41 ex-smokers. Twenty-six patients donated a second sputum sample, approximately 6 months after the initial sample. Sputum cell gene expressions of IL13, CLCA1, CCL26 and CST1 were assessed by quantitative RT-PCR. Differential cell counts were performed.Results: Expression levels of all four genes significantly correlated with sputum eosinophil percentages. IL13 and CCL26 gene expression levels were significantly lower in COPD current versus ex-smokers (IL13 p< 0.0001; CCL26 p=0.005); there were no differences for CLCA1 or CST1. In repeat samples, IL13, CCL26 and CST1 expression showed good or very good consistency, while CLCA1 levels were more variable.Conclusion: Sputum gene expression of IL13 and CCL26 is affected by the smoking status of COPD patients and have stable expression over time. These findings implicate IL-13 and CCL26 as key components of T2 inflammation in COPD but also suggest that current smoking skews the immune response away from a T2 profile.Keywords: COPD, sputum, type 2 inflammation, smoking
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».