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Enregistrement W7090783415 · doi:10.5061/dryad.w0vt4b959

Haplodiploidy accelerates mitogenome evolution in insects

2025· dataset· en· W7090783415 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueDRYAD · 2025
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIndelMitochondrial DNAHaplodiploidyGeneGenomePhylogenetic treeNuclear geneMutationPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rates of mitogenome evolution differ among animal lineages, and this variation has been linked to life history, ecological traits, and— potentially—to sex-determination system. Insects are a strong model for examining the latter factor because haplodiploidy (HD) has evolved on multiple occasions from a diplodiploid (DD) ancestral state. We tested for rate differences between DD and HD taxa by examining sequence change in a sentinel segment of the mitogenome, the 658 bp barcode region of the cytochrome c oxidase I (COI) gene. Specifically, we investigated if amino acid substitutions and indels are more frequent in HD than DD lineages by inspecting COI sequences from over 86,000 BINs (a species proxy) representing 783 insect families and 26 orders. Among them, ten lineages, varying in rank from tribe to order, are HD. Our analysis, which accounts for phylogeny, indicates that HD lineages have higher rates (1.7×) of amino acid substitution, higher Ka/Ks (3.5×), and far more indels than DD taxa. While our results demonstrate that HD accelerates mitogenome evolution, future work needs to clarify its mechanistic basis. We hypothesize that HD facilitates positive selection for mitochondrial mutations which encode proteins that interact with nuclear gene products. Such coevolutionary interactions should be facilitated because recessive mutations in the nuclear genome are fully exposed to selection in males of HD but not DD lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,889

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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