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Enregistrement W7090946213 · doi:10.60723/9976

A case of PSMC5-associated neurodevelopmental proteasomopathy

2025· dataset· en· W7090946213 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueGestaltMatcher · 2025
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypotoniaExome sequencingGlobal developmental delayFailure to thriveHearing lossGenetic testingCHARGE syndromePhysical examinationGenetic counselingMicrocephaly

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A 7-year-old male was seen in consultation by a Clinical Genetics team for bone marrow failure and global developmental delay. He was born to non-consanguineous White parents of Western European descent. He was born at term by spontaneous vaginal delivery after an unremarkable pregnancy. He presented to care in the neonatal period with congenital thrombocytopenia, which evolved over time into unexplained bone marrow failure. Additional medical issues included childhood-onset seizures treated with levetiracetam, bilateral hearing loss requiring hearing aids, non-congenital scoliosis requiring bracing, joint instability requiring ankle foot orthoses, and multiple aspiration pneumonias leading to gastrostomy tube insertion for feeding. He had hypotonia and global developmental delay without stagnation or regression. Brain MRI in early childhood identified mild global hypomyelination. At age 7 years, his cognitive functioning had not yet been formally assessed. He had a diagnosis of autism spectrum disorder and was non-verbal. He was able to walk independently with an abnormal gait, and to climb stairs (not descend) with assistance. He could do some limited tracing with a pencil, but required someone to hold his hand to do so accurately. He had undergone extensive molecular and cytogenetic testing earlier in life for the bone marrow failure that was non-diagnostic. Chromosomal microarray analysis revealed normal male copy number. Trio exome sequencing identified a de novo missense variant in PSMC5 [NM_002805.5: c.973C>T;p.(Arg325Trp)]. On examination at age 7 years, his height z-score was -0.62, his weight z-score was -1.12, he was normocephalic, and he was noted to have distinctive facial features (see photo).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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