PREDICTING SUITABLE MARINE HABITAT FOR PINK-FOOTED SHEARWATERS (<i>ARDENNA CREATOPUS</i>) IN THE WATERS ALONG THE PACIFIC COAST OF CANADA
Notice bibliographique
Résumé
This set of files contains the R code and input data used to run a Generalized Additive Model (GAM) for Pink-footed Shearwaters (PFSH) in Canadian Pacific waters. The model uses standardized at-sea survey data (1992–2019) to predict species presence and relative abundance in relation to key environmental covariates.The .R script includes data preparation, model fitting, validation, and prediction steps. The accompanying .csv file provides the standardized 2 km² observation dataset, and the shapefile defines the study area boundary used for mapping model outputs. Manuscript Abstract: Anthropogenic activities are threatening global marine ecosystems, with seabirds representing a vulnerable group that has experienced pronounced population declines in recent decades. The ability to identify important marine areas for vulnerable seabirds is fundamental to conservation initiatives. The Pink-footed Shearwater (Ardenna creatopus; listed as Endangered in Canada) breeds only in Chile, but during the non-breeding season it ranges northward to waters off Canada’s Pacific coast and the northern Gulf of Alaska. Utilizing at-sea survey data spanning from 1992 to 2019, we examined the relationship between the species’ distribution and environmental variables using a two-step Generalized Additive Model approach. Cross-validation with out-of-sample testing showed high predictive accuracy for occurrence (AUC = 0.94) and moderate performance for abundance predictions (Spearman’s rank correlation = 0.32, RMSE = 3.92, MAE = 0.45) at a 4 km² resolution. The results give us confidence in the model’s ability to identify areas suitable for Pink-footed Shearwaters. Distribution was strongly associated with several oceanographic and geographic factors, particularly latitude and distance to the continental shelfbreak. The findings of this study may help inform marine conservation efforts within Canada’s Pacific Exclusive Economic Zone and beyond.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».