Differences in intrinsic cellular O-GlcNAcylation impact response to metabolic stress
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The cellular response to metabolic stress is complex and involves various signals and pathways leading to cellular adaptation. AMP-activated Protein Kinase (AMPK) senses nutrient insufficiency reflected in the ratio of ATP to AMP/ADP and/or glucose availability. In addition, the dynamic modification of proteins with O-linked β-N-Acetylglucosamine (O-GlcNAc) by O-GlcNAc transferase (OGT) is also nutrient sensitive, given that the substrate for this modification is the product of the hexosamine biosynthetic pathway. AMPK can also regulate the hexosamine biosynthetic pathway, and O-GlcNAc may reciprocally regulate AMPK activity under some contexts. However, it remains unclear which parameters establish the extent of reciprocal regulation of AMPK and protein O-GlcNAc modification and whether these signals can be orthogonal under some circumstances. Here, we used ARPE-19 and MDA-MB-231 cells to examine how nutrient limitation or pharmacological activation combined with inhibition of AMPK and O-GlcNAcylation impacts the activation of the reciprocal pathway. We found that the intrinsic level of global protein O-GlcNAc modification may impact how AMPK and metabolic stress regulate global O-GlcNAcylation, and that both signaling systems could be orthogonal in some contexts. These results contribute to understanding the complexity of cellular signaling in response to nutrient availability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».