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Enregistrement W7094998811 · doi:10.1101/2025.10.24.684323

Differences in intrinsic cellular O-GlcNAcylation impact response to metabolic stress

2025· preprint· W7094998811 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSimon Fraser University
Mots-clésAMPKProtein kinase ANutrient sensingMetabolic pathwaySignal transductionAMP-activated protein kinaseCellular stress responsePosttranslational modificationRegulator

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The cellular response to metabolic stress is complex and involves various signals and pathways leading to cellular adaptation. AMP-activated Protein Kinase (AMPK) senses nutrient insufficiency reflected in the ratio of ATP to AMP/ADP and/or glucose availability. In addition, the dynamic modification of proteins with O-linked β-N-Acetylglucosamine (O-GlcNAc) by O-GlcNAc transferase (OGT) is also nutrient sensitive, given that the substrate for this modification is the product of the hexosamine biosynthetic pathway. AMPK can also regulate the hexosamine biosynthetic pathway, and O-GlcNAc may reciprocally regulate AMPK activity under some contexts. However, it remains unclear which parameters establish the extent of reciprocal regulation of AMPK and protein O-GlcNAc modification and whether these signals can be orthogonal under some circumstances. Here, we used ARPE-19 and MDA-MB-231 cells to examine how nutrient limitation or pharmacological activation combined with inhibition of AMPK and O-GlcNAcylation impacts the activation of the reciprocal pathway. We found that the intrinsic level of global protein O-GlcNAc modification may impact how AMPK and metabolic stress regulate global O-GlcNAcylation, and that both signaling systems could be orthogonal in some contexts. These results contribute to understanding the complexity of cellular signaling in response to nutrient availability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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