MITOCHONDRIAL CYTOCHROME B SEQUENCE DIVERGENCE AMONG SPANISH, ALPINE AND ABRUZZO
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT- We have studied genetic divergence and phylogenetic relationships of Alpine, Spanish and Abruzzo chamois (genus Rupicapra) by sequencing a region of 330 nucleotides within the mito-chondrial DNA cytochrome b gene (mtDNA cyt 6). These sequences were aligned with additional ho-mologous sequences of Caprinae: Japanese serow, Chinese goral, Canadian mountain goat, Mishmi takin, muskox, Sardinian mouflon and domestic goat. Results suggest that, using representatives of the Bovini as outgroups, the Caprinae constitute a monophyletic clade. However, inferred phyloge-netic relationships among and within tribes of Caprinae were poorly defined and did not reflect cur-rent evolutionary and taxonomical views. In fact, the Asian Rupicaprini goral and serow constituted a strongly supported clade, which included the muskox, while the takin grouped with Uvis. Therefore, the monophyly of Ovibovini was not supported by cyt b sequences. Species of Rupicapra joined a strongly supported monophyletic clade, which was distantly related to the Asian rupicaprins and Ore-amnos. Therefore, the monophyly of the Rupicaprini was not supported by these cyt h sequences. There were sister species relationships within Rupicapra, Spanish and Alpine chamois and the Abruz-zo chamois (Rupicupru pyrenaica ornata) was strictly related to the Spanish chamois (Rupicapra pyre-naica parva), as previously suggested by allozyme data and hiogeographic reconstructions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».