Molecular Characterization of Fowl Adenovirus Serotype 4 (FAV-4) Isolate Associated with Fowl Hydropericardium-Hepatitis Syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract.- A study was conducted to characterize local fowl adenovirus serotype 4 (FAV-4) associated with hydropericardium syndrome (HPS) at molecular level. For this purpose, chicken livers naturally infected with HPS virus were aseptically collected from a field outbreak in commercial broilers from Faisalabad, Pakistan. Virus purification was done using a 15-45 % (w/v) sucrose gradient. Virus was confirmed by agar gel precipitation test. Viral DNA was extracted and variable region hexon gene of 0.7 kb in size was amplified by PCR and sequenced. Nucleotide sequence (730 bp) and deduced amino acid sequence (243) of isolate was compared with already published sequences of FAV4. Sequence analysis of the variable region hexon gene confirmed that the virus belonged to avian adenovirus serotype 4. The nucleotide sequence of the Pakistani isolate had a 94 % to 98 % homology with Indian isolates, 97 % homology with Belgium and Russian isolates and 96 % homology with Canadian isolate. The amino acid sequences of the Pakistani isolate had an almost 87 % to 98 % homology with Indian, 92 % and 95 % homology with Belgian, 96 % homology with Russian and 95 % homology with Canadian isolate. Key words: amino acid sequencing, fowl adenovirus 4, hexon gene, hydropericardium-hepatitis syndrome, Pakistani isolate
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».