A single-step multiplex PCR assay for the detection of European Peristenus spp., parasitoids of Lygus spp.
Notice bibliographique
Résumé
Lygus Hahn (Hemiptera: Miridae) are serious pests of agricultural and greenhouse crops throughout North America. In Europe, bivoltine Peristenus Förster (Hymenoptera: Braconidae) species have a significant impact on Lygus populations. Release and establishment of European P. digoneutis Loan in Lygus lineolaris (Palisot de Beauvois) populations in northeastern USA has renewed interest in the intended liberation of European parasitoids for Lygus control in Canada. Accurate identification of natural enemies is the cornerstone of biological control but conventional methods for identifying Peristenus species and estimating parasitism rates rely on tedious and time-consuming dissection and rearing methods. The present study describes species-specific PCR primers for three species of Peristenus, and the use of a multiplex PCR assay to detect P. digoneutis and P. stygicus Loan eggs and larvae from Lygus rugulipennis Poppius nymphs. Results indicate that the primers amplify uniquely sized, species-specific PCR products for the three species and are capable of detecting single eggs in parasitized nymphs within 3 days post-parasitism. Using a multiplex PCR assay, the primers maintain specificity and sensitivity, and allow detection of each of the three species in a single reaction. Although molecular diagnostics have previously been used in the identification of parasitoids and estimation of parasitism rates, this is the first time a single-step multiplex PCR protocol has been described.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».