A rticle How the Mountain Pine Beetle (Dendroctonus ponderosae) Breached the Canadian Rocky Mountains
Notice bibliographique
Résumé
The mountain pine beetle (MPB; Dendroctonus ponderosae Hopkins), a major pine forest pest native to western North America, has extended its range north and eastward during an ongoing outbreak. Determining how the MPB has expanded its range to breach putative barriers, whether physical (nonforested prairie and high elevation of the Rocky Mountains) or climatic (extreme continental climate where temperatures can be below 40 C), may contribute to our general understanding of range changes as well as management of the current epidemic. Here, we use a panel of 1,536 single nucleotide polymorphisms (SNPs) to assess population genetic structure, connectivity, and signals of selection within this MPB range expansion. Biallelic SNPs in MPB from southwestern Canada revealed higher genetic differenti-ation and lower genetic connectivity than in the northern part of its range. A total of 208 unique SNPs were identified using different outlier detection tests, of which 32 returned annotations for products with putative functions in choles-terol synthesis, actin filament contraction, and membrane transport. We suggest that MPB has been able to spread beyond its previous range by adjusting its cellular and metabolic functions, with genome scale differentiation enabling populations to better withstand cooler climates and facilitate longer dispersal distances. Our study is the first to assess landscape-wide selective adaptation in an insect. We have shown that interrogation of genomic resources can identify
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».