Salat-Canela et al. Internal translation of the Connexin 43 transcript Supplementary Methods
Notice bibliographique
Résumé
Primary human keratinocytes and fibroblasts were obtained and cultured as previously described [1]. Wild-type and Mnk1/2 knockout mouse embryonic fibroblasts (MEFs) [2] were a gift from the Nahum Sonenberg laboratory (McGill University, Canada), and were cultured in DMEM with 10 % FBS and 1 % penicillin/streptomycin. All other cell lines were obtained from ATCC and cultured as recommended in DMEM with 10 % FBS and 1 % penicillin/streptomycin. Cells were treated overnight (unless indicated otherwise in the manuscript) with 40 µM CGP 57380 (Tocris Bioscience) or 100 nM Rapamycin (Tocris Bioscience). RNA interference and microRNA studies. Mission endoribonuclease-prepared siRNA (esiRNA) control and esiRNA targeting the entire GJA1 coding region (obtained from Sigma) were transfected with RNAiMax according to the recommended protocol (Life Technologies) using 1000ng esiRNA per well in 6-well plates. Targeting eIF4E was performed with a proven standard Flexitube siRNA from Qiagen (#SI00300125). Hsa-miR-1, has-miR-206 and –ve control miR-mimick were obtained from Ambion (#4464066, Life Technologies) and transfected with RNAiMax to a final concentration of 25 nM. Cells were harvested 48 hours post-transfection. Western blotting and antibodies Cells were lysed in RIPA buffer (Santa Cruz) and western blotting was performed as previously described [3]. The antibodies used were rabbit polyclonal anti-Cx43 directed against the C-terminal (abcam #ab11-370, 1:10000, or Sigma Aldrich 1 Salat-Canela et al. Internal translation of the Connexin 43 transcript #C6219, 1:10000), mouse monoclonal anti–a-tubulin (abcam #ab7291, 1:10000), anti-
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,119 | 0,058 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».