MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7100302681

Salat-Canela et al. Internal translation of the Connexin 43 transcript Supplementary Methods

2014· article· en· W7100302681 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfectionConnexinBlotMessenger RNAPolyclonal antibodiesCell cultureMonoclonal antibodyTranslation (biology)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary human keratinocytes and fibroblasts were obtained and cultured as previously described [1]. Wild-type and Mnk1/2 knockout mouse embryonic fibroblasts (MEFs) [2] were a gift from the Nahum Sonenberg laboratory (McGill University, Canada), and were cultured in DMEM with 10 % FBS and 1 % penicillin/streptomycin. All other cell lines were obtained from ATCC and cultured as recommended in DMEM with 10 % FBS and 1 % penicillin/streptomycin. Cells were treated overnight (unless indicated otherwise in the manuscript) with 40 µM CGP 57380 (Tocris Bioscience) or 100 nM Rapamycin (Tocris Bioscience). RNA interference and microRNA studies. Mission endoribonuclease-prepared siRNA (esiRNA) control and esiRNA targeting the entire GJA1 coding region (obtained from Sigma) were transfected with RNAiMax according to the recommended protocol (Life Technologies) using 1000ng esiRNA per well in 6-well plates. Targeting eIF4E was performed with a proven standard Flexitube siRNA from Qiagen (#SI00300125). Hsa-miR-1, has-miR-206 and –ve control miR-mimick were obtained from Ambion (#4464066, Life Technologies) and transfected with RNAiMax to a final concentration of 25 nM. Cells were harvested 48 hours post-transfection. Western blotting and antibodies Cells were lysed in RIPA buffer (Santa Cruz) and western blotting was performed as previously described [3]. The antibodies used were rabbit polyclonal anti-Cx43 directed against the C-terminal (abcam #ab11-370, 1:10000, or Sigma Aldrich 1 Salat-Canela et al. Internal translation of the Connexin 43 transcript #C6219, 1:10000), mouse monoclonal anti–a-tubulin (abcam #ab7291, 1:10000), anti-

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1190,058

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetConnexins and lens biologyTravaux en français237 207