Rpr1, a gene required for Rpg1-dependent resistance to stem rust in barley. Theoretical and Applied Genetics 113: 847–855
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rpg1 is a stem rust resistance gene that has protected barley from severe losses for over 60 years in the US and Canada. It confers resistance to many, but not all, pathotypes of the stem rust fungus Puccinia graminis f. sp. tritici. A fast neutron induced deletion mutant, showing susceptibility to stem rust pathotype Pgt-MCC, was identiWed in barley cv. Morex, which carries Rpg1. Genetic and Rpg1 mRNA and protein expression level analyses showed that the mutation was a suppressor of Rpg1 and was designated Rpr1 (Required for P. graminis resistance). Genome-wide expression proWling, using the AVymetrix Barley1 GeneChip containing »22,840 probe sets, was con-ducted with Morex and the rpr1 mutant. Of the genes represented on the Barley1 microarray, 20 were up-regulated and 33 were down-regulated by greater than twofold in the mutant, while the Rpg1 mRNA level remained constant. Among the highly down-regulated genes (greater than fourfold), genomic PCR, RT-PCR and Southern analyses identiWed that three genes (Contig4901_s_at, HU03D17U_s_at, and Contig 7061_s_at), were deleted in the rpr1 mutant. These three genes mapped to chromosome 4(4H) bin 5 and co-segregated with the rpr1-mediated susceptible phe-notype. The loss of resistance was presumed to be due to a mutation in one or more of these genes. However, the possibility exists that there are other genes within the deletions, which are not represented on the Bar-ley1 GeneChip. The Rpr1 gene was not required for Rpg5- and rpg4-mediated stem rust resistance, indicat-ing that it shows speciWcity to the Rpg1-mediated resis-tance pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».