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Enregistrement W7101382276 · doi:10.1063/4.0001099

Solution Characterization and Initial Crystallization Studies of TrbB from the F Plasmi

2025· article· en· W7101382276 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueStructural Dynamics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriplasmic spacePlasmidVirulenceBacterial conjugationSecretionPilusBacteriaTransmembrane proteinDNA gyraseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Secretion systems, found across gram-negative and gram-positive bacteria, are large multi-protein complexes responsible for the transport of genetic material and proteins across phospholipid membranes, with dedicated systems in place for the secretion of virulence factors into host cells or the environment. One such pathway can be found in Gram-negative bacteria bearing conjugative F-like plasmids is known as the Type IV Secretion System (T4SSF). This system comprises multiple proteins responsible for cell proliferation, transport of virulence factors and antibiotic resistance genes through bacterial conjugation. Bacterial conjugation involves the assembly of a transmembrane conjugative pili for Gram negative bacteria bearing F-like plasmids, that is responsible for plasmid DNA transfer. TrbB is a periplasmic protein encoded by the F- plasmid transfer region (tra), with disulfide isomerase and reductase activity. TrbB is proposed to be involved in the assembly of the F-pilus and aid in protein folding for other T4SSF proteins. Previous studies of full-length TrbB indicated a dynamic N-terminal domain likely responsible for protein-protein interactions. In the current study, we present recent SEC-MALS-SAXS data and initial high-throughput crystallization trials of an N- terminally truncated TrbB construct (TrbB37-161). SAXS data indicates several species in solution (monomer, dimer, tetramer), and crystallization trials identify several promising leads for further optimization. Noting the important role of conjugation in the the spread of antibiotic resistance genes and TrbB’s role in assembly of the conjugative F-pilus, further structural investigation may lead to improved strategies for curtailing the spread of antibiotic resistant pathogens with multidrug resistance

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,383
Score d'incertitude au seuil0,228

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle