Solution Characterization and Initial Crystallization Studies of TrbB from the F Plasmi
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Notice bibliographique
Résumé
Secretion systems, found across gram-negative and gram-positive bacteria, are large multi-protein complexes responsible for the transport of genetic material and proteins across phospholipid membranes, with dedicated systems in place for the secretion of virulence factors into host cells or the environment. One such pathway can be found in Gram-negative bacteria bearing conjugative F-like plasmids is known as the Type IV Secretion System (T4SSF). This system comprises multiple proteins responsible for cell proliferation, transport of virulence factors and antibiotic resistance genes through bacterial conjugation. Bacterial conjugation involves the assembly of a transmembrane conjugative pili for Gram negative bacteria bearing F-like plasmids, that is responsible for plasmid DNA transfer. TrbB is a periplasmic protein encoded by the F- plasmid transfer region (tra), with disulfide isomerase and reductase activity. TrbB is proposed to be involved in the assembly of the F-pilus and aid in protein folding for other T4SSF proteins. Previous studies of full-length TrbB indicated a dynamic N-terminal domain likely responsible for protein-protein interactions. In the current study, we present recent SEC-MALS-SAXS data and initial high-throughput crystallization trials of an N- terminally truncated TrbB construct (TrbB37-161). SAXS data indicates several species in solution (monomer, dimer, tetramer), and crystallization trials identify several promising leads for further optimization. Noting the important role of conjugation in the the spread of antibiotic resistance genes and TrbB’s role in assembly of the conjugative F-pilus, further structural investigation may lead to improved strategies for curtailing the spread of antibiotic resistant pathogens with multidrug resistance
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle