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Enregistrement W7104000651 · doi:10.1080/07060661.2025.2573936

Survey and first molecular characterization of <i>Banana bunchy top virus</i> infecting <i>Musa</i> spp. cv. Sabri in Bangladesh

2025· article· en· W7104000651 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdentification (biology)PopulationPolymerase chain reactionGenomeOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Banana bunchy top virus (BBTV) is a major viral pathogen in bananas, capable of causing up to 100% yield loss. This study investigated the prevalence and molecular characterization of BBTV in three major banana-growing districts – Rajshahi, Natore and Pabna – in Bangladesh. Field surveys revealed that BBTV was the most widespread viral disease, with a 62.7% infection rate in Musa sp. cv. Sabri. All six genomic components (DNA-R, -U3, -S, -M, -C, and -N) of BBTV were successfully amplified using gene-specific primers from isolates in all three districts. DNA sequencing of the Rajshahi isolates revealed 99.96–100% nucleotide identity with the corresponding genomic components of isolates from Natore and Pabna. BLASTn analysis revealed 92–98% nucleotide identity with known BBTV sequences, indicating a close relationship with Indian isolates. Phylogenetic analysis suggests that the Rajshahi isolates belong to the South Pacific group. The six primer sets used in this study proved effective for BBTV detection and are suitable for indexing virus-free tissue culture banana seedlings. This is the first molecular confirmation of BBTV infection in the Sabri cultivar in Bangladesh, underscoring a significant threat to regional banana production and the need for urgent management strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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