Dynamique de colonisation des poulets de chair par deux souches de Campylobacter jejuni et interactions hôte-pathogène

Campylobacter jejuni est reconnu comme la principale bactérie d’origine alimentaire responsable de gastroentérites humaines dans le monde. C. jejuni réside dans le tractus gastrointestinal de divers animaux, incluant la volaille reconnue comme étant la principale source de transmission aux humains. En raison du nombre important de campylobactérioses humaines et de l’augmentation de la consommation de poulets, il est primordial de garantir la salubrité alimentaire de la viande et des foies de poulets. L’une des stratégies repose sur la réduction de la colonisation des oiseaux par C. jejuni grâce à des mesures de contrôle à la ferme. Toutefois, un contrôle adéquat de Campylobacter chez la volaille nécessite avant tout une compréhension plus approfondie de sa colonisation. Bien que les oiseaux puissent être colonisés par différentes souches de C. jejuni compétitionnant les unes avec les autres, les mécanismes sous-jacents demeurent inconnus. Par ailleurs, la dissémination extra-intestinale de C. jejuni est très peu étudiée à ce jour. Finalement, aucune étude expérimentale évaluant les réponses immunitaires locales et systémiques induites par la colonisation de C. jejuni n’a été réalisée avec plus d’une souche. Par conséquent, cette thèse visait donc à évaluer l’impact d’une mono-infection et d’une co-infection avec deux souches de C. jejuni possédant des potentiels de compétition opposés sur leur colonisation cæcale et iléale, sur leur translocation vers le foie et sur les réponses immunitaires locales et systémiques des poulets. En outre, la colonisation intestinale de C. jejuni requière la disponibilité en acides aminés, tels que la sérine, le glutamate et la proline, pour coloniser avec succès les caeca. Ainsi, cette thèse a également évalué une mesure de contrôle reposant sur la modulation de la disponibilité en acides aminés par l’ajout d’une protéase à des moulées contenant différentes sources de protéines. Des poulets de chair de 14 jours d’âge ont été inoculés avec différentes doses de deux souches de C. jejuni possédant des potentiels de compétition opposés. Dépendamment de l’inoculum, nous avons constaté que la souche fortement compétitrice pouvait aider la souche faiblement compétitrice à coloniser l’intestin des poulets ou que les deux souches compétitionnaient l’une avec l’autre. Contrairement à la souche fortement compétitrice, nous avons observé que la souche faiblement compétitrice était capable de rejoindre et de dominer le parenchyme hépatique. La souche faiblement compétitrice semblait également profiter de la présence de la souche fortement compétitrice pour faciliter et accélérer sa propre translocation hépatique. Nous avons également observé une diminution du niveau d’expression de certaines protéines des jonctions serrées dans le tissu iléal, suggérant que C. jejuni pourrait compromettre l’intégrité de la barrière intestinale pour rejoindre le foie. De plus, C. jejuni semble moduler la réponse immunitaire intestinale afin de faciliter sa dissémination hépatique. Par ailleurs, la contamination du parenchyme hépatique par C. jejuni a déclenché une réponse immunitaire hépatique, a mené à la production des IgYs spécifiques dans le sérum des poulets et ainsi qu’à la production de l’amyloïde sérique A, une protéine de la phase aigüe, pour certaines conditions. Afin d’évaluer l’efficacité de la mesure de contrôle sur la colonisation intestinale et la translocation de C. jejuni, une protéase a été ajoutée à des moulées contenant des protéines animales ou végétales. Les poulets ont été inoculés à 14 jours d’âge par les deux mêmes souches de C. jejuni que précédemment. L’ajout de la protéase à la moulée végétale a augmenté les niveaux de colonisation iléale de C. jejuni, a diminué sa colonisation cæcale et a inhibé sa translocation hépatique. En revanche, l’ajout de la protéase à la moulée animale n’a eu aucun effet sur les niveaux de colonisation iléale et cæcale de C. jejuni. Contrairement à la moulée animale, l’ajout de la protéase à la moulée végétale a modifié la diversité et la structure du microbiote cæcal des poulets. Afin de visualiser les relations entre Campylobacter et les autres genres bactériens du microbiote cæcal, des réseaux d’associations microbiennes ont été construits. L’ajout de la protéase à la moulée végétale n’a pas eu d’impact sur la structure du réseau d’association microbienne, mais a tout de même conduit à une modification des taxons bactériens interagissant avec Campylobacter. Ces résultats permettent de mieux comprendre les interactions entre souches de C. jejuni pour la colonisation intestinale et la dissémination hépatique des poulets. De plus, la modulation de la disponibilité en acides aminés par la protéase a donné des résultats prometteurs afin de contrôler C. jejuni chez la volaille. L’ensemble de ces résultats contribueront à l’élaboration de traitements adéquats afin de contrôler la colonisation intestinale et de la dissémination extra-intestinale de Campylobacter chez la volaille.

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