Diversité et taxonomie des Mymaridae (Hymenoptera: Chalcidoidea) des forêts tempérées du Québec
Notice bibliographique
Résumé
Les Mymaridae (Hymenoptera : Chalcidoidea) forment un groupe diversifié, mais taxonomiquement négligé de guêpes parasitoïdes qui s’attaquent aux œufs d’autres insectes. Elles sont souvent ignorées dans les études sur la biodiversité, bien qu’elles soient parmi les micro-hyménoptères les plus abondants de nombreux habitats. L’approche traditionnelle du tri morphologique pour la délimitation des espèces peut s’avérer difficile en raison de leur taille minuscule et de la technique de montage sur lames de microscope. Il importe donc de trouver des approches afin d’accélérer leur découverte. L’objectif principal de ce mémoire était de décrire la diversité des Mymaridae dans les forêts tempérées du Québec à l’aide d’une approche taxonomique intégrative. Nous souhaitions également générer une bibliothèque de référence de codes-barres d’ADN, en plus de mettre à jour la distribution géographique des espèces de cette famille. Nous avons donc mené la première étude de caractérisation à grande échelle des Mymaridae, en combinant le mégabarcodage de l’ADN et le protocole de taxonomie intégrative à grande échelle (LIT) pour décrire leur diversité. Nous avons obtenu les codes-barres COI de 2098 spécimens et utilisé différents algorithmes pour la délimitation des espèces. Entre 42 et 114 groupes moléculaires ont été délimités. La validation morphologique de 9% de l’échantillon a permis une délimitation précise tout en limitant le temps et les efforts requis. Nous avons confirmé la présence de 55 espèces, dont plusieurs sont potentiellement nouvelles pour la science. Le protocole LIT s’est avéré efficace pour les Mymaridae, bien que la diversité cryptique ne soit pas résolue dans certains grands groupes, en particulier chez les genres Alaptus et Anagrus, où la grande diversité des haplotypes et l’ambiguïté morphologique suggèrent l’existence d’autres espèces cachées. Les bases de données d’ADN existantes se sont révélées peu fiables, avec moins de 1% d’identifications exactes au niveau de l’espèce, ce qui met en évidence les lacunes taxonomiques de ce groupe. Néanmoins, nous avons ajouté 16 nouveaux codes-barres de référence aux bases de données publiques et de nouvelles mentions d’espèces provinciales et nationales pour le Canada. Nos résultats démontrent la valeur de la combinaison des données moléculaires et morphologiques en taxonomie et soulignent l’importance de bonifier les bases de données de référence pour des évaluations efficaces de la biodiversité des taxons négligés, dont les micro-hyménoptères.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».