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Enregistrement W7106287717 · doi:10.5281/zenodo.17675089

Training data and ensemble results of an ensemble of models trained to find flowers on herbarium sheet images

2025· article· W7106287717 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2025
Typearticle
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueBiological and pharmacological studies of plants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHerbariumMetadataPhenologyTraining (meteorology)Training setEnsemble learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This contains the 3 image datasets (training, validation, testing/holdout) for training models to identify flowers on images of herbarium sheets. Metadata for the images are located at https://github.com/rafelafrance/phenobase/blob/v1.0.0/datasets/splits_2025-04-22.csv. The 3 models were ultimately used in an ensemble for flower identification. flower_inference_formatted_2025-10-30.zip contains the formatted output of the ensemble and flower_inference_votes_2025-09-02.zip contains the raw ensemble votes. See the paper Petal to the metal? The slow road to automating large-scale phenology labeling for herbarium specimens Erin L. Grady1, Raphael LaFrance1, Daijiang Li2, Russell Dinnage3,4, Ellen G. Denny5, John Deck6 and Robert P. Guralnick1 1 Florida Museum of Natural History, University of Florida, Gainesville, Florida, USA 2 Department of Botany, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, USA 3 Department of Biological Sciences, University of Alberta, Edmonton, AB, Canada 4 Alberta Machine Intelligence Institute, Edmonton, AB, Canada 5 USA National Phenology Network, School of Natural Resources and the Environment, University of Arizona, Tucson, Arizona, USA 6 Berkeley Natural History Museums, University of California, Berkeley, California, USA Corresponding author: Erin Grady; gradyerin@ufl.edu

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,729
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,152
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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