Sputum Cytokine Repeatability in COPD
Notice bibliographique
Résumé
Alex Mulvanny,1 Augusta Beech,1,2 Jian Li,2 Simon Lea,2 Dave Singh1,2 1Bioanalytical Department, Medicines Evaluation Unit, Manchester, UK; 2Division of Infection, Immunity and Respiratory Medicine, University of Manchester, Manchester, UKCorrespondence: Alex Mulvanny, Bioanalytical Department, Medicines Evaluation Unit, Manchester, UK, Tel +44 161 946 4066, Email amulvanny@meu.org.ukIntroduction: Sputum biomarker measurements are used to measure airway inflammation in COPD patients. We have previously validated a Luminex assay able to quantify 15 analytes in COPD sputum supernatant. This assay demonstrated sputum protein expression profiles associated with neutrophilia, airway bacterial colonisation and current smoking in COPD.Methods: We report repeat sputum supernatant analysis at 6 months from a sub-group of COPD patients who participated in the original study. 48 COPD patients provided a repeat sputum sample at 6 months. 15 panel analytes were detectable.Results: Repeated sputum cytokine measurements showed a significant positive correlation between baseline and 6 months for all analytes except IL-1RA with intraclass correlation coefficient (ICC) indicating good to excellent repeatability. IL-1β, IL-2, IL-8, IL-17A, G-CSF, MIP-1α, MIP-1β and TNF-α were significantly correlated with sputum neutrophil percentage at 6 months. IL-1β, IL-4, IL-8 and G-CSF were significantly increased in Haemophilus influenzae colonised patients and IL-1β, IL-4, IL-8, G-CSF, IFN-γ, IP-10, MCP-1, MIP-1α, MIP-1β and TNF-α were significantly higher in ex-smoking COPD patients.Discussion: A multiplex immunoassay used at repeated visits in COPD patients showed a high degree of reproducibility for the majority of analytes. There were reproducible inflammatory signatures in sputum associated with clinical characteristics in COPD patients.Keywords: biomarker, validation, luminex, inflammation, respiratory
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».