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Enregistrement W7108080870 · doi:10.5281/zenodo.17772156

Computational Framework for Multi-Target Cancer Pathway Convergence

2025· preprint· W7108080870 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensSociety for the Study of Architecture in Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerMechanism (biology)Cancer drugsClinical trialDrug developmentDiseaseDrug discoveryCancer cellBiopharmaceutical

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

【THE PROBLEM】 Cancer drug development has a 99.6% failure rate, with only 3.4% of drugs progressing from Phase I to FDA approval. Single-target therapies consistently fail because cancer cells activate compensatory pathways when one target is blocked. ◆ 【KEY INSIGHT】 Despite genetic heterogeneity across thousands of cancer mutations, all cancers converge on 6 universal downstream pathways: • (1) Translation/Ribosome Biogenesis (NOLC1-regulated) • (2) Nucleotide Synthesis (purine/pyrimidine) • (3) Mitochondrial Reprogramming (ATP production) • (4) One-Carbon Metabolism (methyl donors) • (5) DNA Damage Response (genomic stability) • (6) Metabolic Plasticity (survival under stress). Analysis of 38 independent datasets (TCGA, GEO, ICGC) covering 33 cancer types and 11,012+ patients confirms these pathways are enriched in 10-12 of 12 major cancer types (83-100% convergence). ◆ 【COMPUTATIONAL FRAMEWORK】 Multi-target botanical combinations targeting all 6 pathways simultaneously through 14 compounds with quantified IC50 values, blood-brain barrier penetration data, and established safety profiles. Mathematical modeling predicts 60-70% net therapeutic efficacy when all pathways are blocked simultaneously, compared to 14-20% for monotherapy, representing 3-5× superiority through network amplification effects. ◆ 【HISTORICAL PRECEDENT】 Multi-drug combinations have transformed treatment outcomes: HIV HAART (50-100× mortality reduction), TB multi-drug therapy (cure vs. death), cancer ABVD for Hodgkin lymphoma (5-8× response improvement). ◆ 【METHODOLOGY】 Systematic computational analysis of cancer genomics datasets, pathway enrichment analysis (GSEA, Reactome, KEGG), compound mechanism verification with IC50 values and clinical evidence, pharmacokinetic modeling for bioavailability and CYP450 interactions, and mathematical framework for synergy coefficient derivation. ◆ 【CRITICAL LIMITATION】 Zero experimental validation. This is a computational hypothesis requiring Phase I-IV trials before clinical use. All projections are evidence-based but not empirically confirmed. Keywords: Cancer, Computational oncology, Multi-target therapy, Pathway convergence, NOLC1, Drug discovery, Systems biology, Therapeutics

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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