Taxonomic and metabolic profiling of glacial ice algal communities on the Greenland Ice Sheet
Notice bibliographique
Résumé
During the summer melt season, glacier ice algal blooms are widespread in the area termed “dark zone” in the southwest region of Greenland. Due to their pigmentation, glacier ice algae reduce the albedo of the ice sheet, increasing surface melting. Despite their crucial role in the Greenland Ice Sheet (GrIS) ecosystem, we know little about their metabolic potential or functions. Here, we present insights into the links between microbial community composition using 18S and ITS2 sequencing and total metabolic profiling of samples dominated by glacier ice algae from the GrIS. Our analysis of ITS2 secondary structures reveals that blooms are dominated by a single algal species, yet glacier ice algal haplotype composition differs between sites (along a 40 km transect) and surface habitats (clean snow vs. high algal biomass ice). Furthermore, metabolic composition changes during the development of glacier ice algal blooms with an accumulation of fatty acids, although few differences were observed between sites along the transect. In addition, a few metabolites showed diurnal variations and our data suggest that under low light and freezing conditions, chlorophyll degradation, tocopherol abundance and phytol remobilization may be the key compounds changing in the glacier ice algae dominated samples. Overall, these results improve our understanding of the chemical environment in the GrIS supraglacial microbial community structure and the contribution of the primary producers dominated by the glacier ice algae. Our data also show that endo- and exo-metabolic patterns need to be differentiated and that multiplexed data sets will help gain a better insight into these complex algae- controlled ecosystems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».