Additional file 1 of Short- and long-term dietary supplementation as well as withdrawal of the enteric methane inhibitor 3-nitrooxypropanol reveal distinct effects on the rumen microbial community
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Table S1. Ingredient and chemical composition of the basal diet in the short-term study. Table S2. Ingredient and chemical composition of the basal diet in the long-term study. Additional file 2: Table S3. Pairwise comparisons of beta diversity of bacterial, archaeal, and protozoal communities after short-term 3-NOP supplementation in beef cattle. Table S4. Pairwise comparisons of beta diversity of bacterial, archaeal, and protozoal communities after long-term 3-NOP supplementation in beef cattle. Table S5. Effects of short-term 3-NOP supplementation on rumen microbial taxa (bacteria, archaea, and protozoa) based on relative and estimated absolute abundances. Table S6. Effects of long-term 3-NOP supplementation on rumen microbial taxa (bacteria, archaea, and protozoa) based on relative and estimated absolute abundances. Table S7. Effects of long-term 3-NOP supplementation and withdrawal on rumen microbial taxa (bacteria, archaea, and protozoa) based on relative and estimated absolute abundances. Table S8. Effects of short-term 3-NOP supplementation on predicted rumen functions based on CowPI. Table S9. Effects of long-term 3-NOP supplementation on predicted rumen functions based on CowPI. Table S10. Summary of microbial co-occurrence network metrics in the short-term 3-NOP supplementation. Table S11. Summary of microbial co-occurrence network metrics in the long-term 3-NOP supplementation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,017 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,852 | 0,129 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».