Butyrophilin Btn3a2 connects Parp9/14 activation downstream of Xrn1 with XIAP/RIPK2 induction.
Notice bibliographique
Résumé
We used a systems biological approach to deciphering mechanism with causative influence in human IBD based on factor identification upstream and downstream of NOD2. Parp9/14 were isolated as common-regulated targets in a transcriptomic discovery approach using multiple IBD-susceptibility genes including NOD2, TRIM22 and XIAP, which revealed Parp9/14 control of the butyrophilins Btn3a2. We demonstrate here that Btn3a2 is associated with a novel MHC class I program whose aligned expression in a network serves as the basis for a mechanism for recognition of self. This self non-self recognition mechanism is likely different from described mechanisms that utilize expression of lymphocyte (Ly) Rhesus (Rh), blood group and transplantation-associated antigens to indicate presence of non-self. Disturbed butyrophilin signaling by BTN3A2 retrieved TNFRSF14, the receptor for LIGHT, a molecule we recently demonstrated was a cardinal Crohn's Disease Montreal B3 phenotype (penetrating/fistulizing-type) susceptibility factor, and whose expression was the major component of a monocyte-macrophage lineage switch associated with transcriptional response to the pathogen-associated molecular pattern muramyl dipeptide (MDP). We demonstrate here a mechanism by which butyrophilin Btn3a2 connects Parp9/14 activation downstream of Xrn1 with XIAP/RIPK2 induction resulting in disease-specific induction of aggressive penetrating disease via TNFRSF14.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».