Analysis of Chloroplast Proteome of Shandan Huangshen (Sphallerocarpus gracilis) During the Tuberous Root Formation
Notice bibliographique
Résumé
Shandan Huangshen (Sphallerocarpus gracilis) is a drought- and alkali-tolerant perennial herb. However, due to overharvesting and habitat degradation, highlighting the urgent need for conservation and artificial cultivation. To elucidate the mechanisms underlying its high adaptability and value, this study investigated the chloroplast proteome during its tuberous root formation using a mass spectrometry-based proteomic approach integrated with LC-MS/MS and bioinformatic analyses. A total of 1,616 chloroplast proteins were identified. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis revealed that the most significantly enriched pathways included metabolic pathways, biosynthesis of amino acids, carbon metabolism, oxidative phosphorylation, photosynthesis, biosynthesis of secondary metabolites, the citrate cycle (TCA cycle), glyoxylate and dicarboxylate metabolism, ribosome function, and proteasome activity. Furthermore, protein-protein interaction network analysis indicated that the core 25-node subnetwork primarily consists of proteins involved in small molecule metabolic processes, single-organism biosynthesis, organic acid metabolism, and oxoacid metabolism. This study provides a comprehensive dataset of the Sphallerocarpus gracilis chloroplast proteome, along with detailed functional annotations, Gene Ontology (GO) enrichment, and KEGG pathway analysis. These findings offer crucial insights into key biological processes in Sphallerocarpus gracilis, advance proteomic research on its high photosynthetic efficiency, and serve as a valuable resource for future functional studies and utilization based on its proteomic profile.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».