Thellungiella halophila ekotiplerinde abiyotik stresle ilişkili MiRNA'ların belirlenmesi.
Notice bibliographique
Résumé
Environmental stress with climate change currently contributes to approximately 50% of crop loss occurring world-wide. Thellungiella halophila is a plant that is native to highly saline and semiarid environments and exhibits an exceptional ability to tolerate abiotic stress. Primarily, the determination of relatively high GSH/GSSG ratios (glutathione assay), elevated proline accumulation, less MDA (lipid peroxidation) production and increased anthocyanin levels and less reduced RWC of the T. halophila (Shandong and Yukon ecotypes) after exposure to increasing concentrations of NaCl allowed us to support that Thellungiella tolerate environmental stress conditions. Genomic studies have shown that differences in stress tolerance arise not only from the presence or absence of stress-associated genes but also from their regulation. In plants, miRNAs are the key gene regulators that have been shown to control various developmental processes and responses to environmental stresses. In order to assess the expression profiles of miRNAs in abiotic stress tolerance of T. halophila ecotypes, salt, cold and drought treatments were carried out. As a result, we identified the changes in the expression profiles of seven conserved miRNAs under 250 mM NaCl, 4°C and 200 mM mannitol using Northern-Blot analysis and TaqMan qRT-PCR assays. Four of the stress related miRNAs (miR156, miR169, miR319 and miR393) were found to be downregulated and three (miR159, miR398 and miR169) were found to be upregulated during exposure to salt, cold and drought stress. Based on the conservation of mature miRNA sequences, potential target genes for miRNAs were also predicted by using conservation of miRNA target sites among species. The target mRNA expression analysis were done by RT-qPCR after exposure to salt stress. RT-qPCR results showed decrease in the expression of miR156, miR169, miR319 and miR393 with a corresponding upregulation of their putative target mRNA transcripts (SPL10, NF-YA5, ITD1 and WRKY33, respectively). In addition, the induction of miR159 was accompanied by the down regulation of its probable target mRNA (HEC1). Taken together, these findings suggest that a number of conserved miRNAs may function in Thellungiella halophila ecotypes tolerance to environmental stresses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».