Classifying aggressiveness on common bean (<i>Phaseolus vulgaris</i> L.) of a Canadian collection of <i>Sclerotinia sclerotiorum</i> L. de Bary isolates
Notice bibliographique
Résumé
Sclerotinia sclerotiorum L. de Bary (Ss) is one of the most destructive pathogens in Canada and around the world. It affects over 500 species of plants, including the economically important common bean. In Canada, its impact is pronounced, necessitating a comprehensive exploration of its diversity and aggressiveness. This study aimed to elucidate the diversity and aggressiveness of Ss isolates collected from commercial fields in three Canadian provinces. Through a dual phenotypic trait analysis of Mycelial Compatibility Groups (MCGs) and aggressiveness determination, we investigated 39 Ss isolates from an interprovincial set and 30 samples from adjacent fields referred to as the proximal subset. Our investigation of MCGs revealed the presence of 18 distinct MCGs in the interprovincial set, suggesting a set of samples with high diversity. Conversely, proximal fields exhibited more clonal behaviour, characterized by only two MCGs. A novel classification system for MCGs based on geographical dispersal and isolate frequency was proposed, delineating Core, Regional, and Endemic MCGs. Aggressiveness testing identified that 82.35% of isolates displayed aggressive responses. In contrast, 17.65% showed mildly aggressive isolates, shedding light on the threat that Ss poses to current commercial fields by displaying predominantly aggressive behaviour among the isolates in the set of samples of study. These phenotypic analyses highlight the complex interactions between Ss isolates and common bean cultivars, providing valuable information for understanding the pathogen’s behaviour. The observed disparity in diversity between interprovincial and proximal fields hints at varied evolutionary pressures, possibly influenced by geographic isolation and agricultural practices. This study outlines MCG and aggressiveness reactions of Ss isolates.Proposed classification system for MCGs enables comparative studies.High diversity in Ss isolates from three Canadian Provinces categorized in 18 MCGs. This study outlines MCG and aggressiveness reactions of Ss isolates. Proposed classification system for MCGs enables comparative studies. High diversity in Ss isolates from three Canadian Provinces categorized in 18 MCGs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».