MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7110852405 · doi:10.1002/ggn2.202500023

Rare Structural Variants Uncovered by Optical Genome Mapping in Multisystem Inflammatory Syndrome in Children (MIS‐C)

2025· article· en· W7110852405 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueAdvanced Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueKawasaki Disease and Coronary Complications
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésDiseaseGenome-wide association studyCausality (physics)InflammationGeneGenomePopulationExonImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Multisystem inflammatory syndrome in children (MIS‐C) is a pediatric complication of SARS‐CoV‐2 infection characterized by multiorgan inflammation and frequently by cardiovascular dysfunction. In a single‐center prospective cohort study, optical genome mapping (OGM) was performed on 14 patients, including 11 meeting CDC criteria for MIS‐C and 3 with MIS‐C–like (MIS‐CL) presentations. SVs and CNVs were filtered against population and internal OGM control databases. Seven patients (50%) harbored prioritized variants within or near genes implicated in immune regulation or SARS‐CoV‐2 response. These included intronic insertions or deletions in ORAI1 , STAT4 , and ITPR1 (n = 4 patients); a heterozygous insertion disrupting BATF ; a large deletion spanning exons 2–10 of CFHR5 ; and an upstream insertion near DOCK2 . Application of OGM to patients with MIS‐C and MIS‐CL revealed SVs potentially impacting inflammation, COVID‐19 severity, and Kawasaki Disease susceptibility. Although causality cannot yet be assigned, the identification of rare structural variants highlights biologically plausible mechanisms that may contribute to disease heterogeneity. These findings establish the feasibility and value of OGM in the assessment of complex pediatric syndromes, such as children with MIS‐C or a severe course of SARS‐CoV‐2 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,777

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAdvanced GeneticsMême sujetKawasaki Disease and Coronary ComplicationsTravaux en français237 207