S1465 Gut Microbiome Dysbiosis as a Diagnostic Signature in Early Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Inflammatory bowel disease (IBD), encompassing ulcerative colitis (UC) and Crohn’s disease (CD), is a persistent inflammatory condition of the digestive tract that is increasing in prevalence worldwide. Early diagnosis remains a challenge, limiting timely intervention. Growing research indicates that gut microbial dysbiosis may precede clinical onset, offering promise as a non-invasive biomarker. This review aims to assess microbiome alterations during early or preclinical IBD. Methods: We conducted a systematic review on the basis of Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. As part of this process, we thoroughly searched 3 major databases-Embase, PubMed, and the Cochrane library for studies that were published between 2018 and 2024. Included studies examined gut microbiota in early or newly diagnosed IBD patients compared to healthy controls. We individually analysed the studies, collected relevant information, and evaluated their quality utilizing the Newcastle-Ottawa Scale and the Cochrane Risk of Bias tool. Results: Twenty studies involving 4,689 participants (2,713 IBD patients, 1,976 controls) met inclusion criteria. Seventeen studies reported significantly reduced alpha diversity in early IBD, with one meta-analysis noting a combined mean difference of −0.45 (95% CI: −0.65 to −0.29; P < 0.001). Beta diversity analyses revealed distinct microbial community structures in IBD groups (P < 0.01 in 12 studies). Taxonomic analyses showed consistent depletion of beneficial commensals, including Faecalibacterium prausnitzii, Roseburia, and Bacteroidetes, in ≥14 studies. Fourteen studies reported enrichment of potentially pathogenic taxa such as Escherichia coli and Ruminococcus gnavus. Furthermore, twelve studies observed a decreased presence of Blautia and Coprococcus, which yield short-chain fatty acids (SCFAs), in early Crohn’s disease, with statistical significance (P < 0.05). Conclusion: This review highlights consistent patterns of microbial dysbiosis in early IBD. The reduction in alpha diversity, loss of anti-inflammatory taxa, and increase in pathobionts precede symptom onset, suggesting their utility as early diagnostic markers. Identifying these microbial signatures offers potential for non-invasive, preclinical screening and risk stratification strategies. Additional longitudinal research is necessary to confirm these biomarkers and incorporate microbiome profiling into individualized preventive healthcare.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,039 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,007 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».