Agammaglobulinemia due to p.E555K <i>TCF3 </i>Dominant-Negative Variant
Notice bibliographique
Résumé
Transcription factor 3 (TCF3) dominant negative (DN) variant causes autosomal dominant (AD) E47 transcription factor deficiency. AD E47 transcription factor deficiency is an inborn error of immunity characterized by B-cell deficiency and agammaglobulinemia. Only the p.E555K variant has been reported as the causative variant in this disease. In this study, we describe the first Asian patient with wide phenotypes due to the p.E555K variant and highlight the unique features that contribute to the exclusivity of this variant. The patient was a 25-year-old male presenting with B-cell deficiency, agammaglobulinemia, and mild facial dysmorphic features. We confirmed the diagnosis of AD E47 transcription factor deficiency by the identification of a heterozygous missense variant c.1663G >A; p.E555K in the TCF3 gene. Alanine scanning of the E47 basic region revealed the structural Utsumi T, et al.3 significance of position 555. In addition, a comprehensive mutational analysis centered on position 555 found that only the amino acid substitution for lysine has a potent DN effect. Structurally the change from glutamic acid to lysine at position 555 not only abolished hydrogen bonds related to the protein-DNA interaction but also inverted the charge in the E47 protein surface. Our study reveals a partial aspect of the exclusivity of the E555K in the TCF3 DN variant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».