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Enregistrement W7111924244

INHIBITING DNA MISMATCH REPAIR IN COLORECTAL CANCER

2023· article· en· W7111924244 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueDigital Access to Scholarship at Harvard (DASH) (Harvard University) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA mismatch repairMLH1Gene knockdownColorectal cancerImmune systemImmunotherapyCancer
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancer (CRC) remains one of the most prevalent cancers in the US with a high mortality rate. Locally advanced and metastatic CRC have poor prognosis and only a small subset (5- 15%) of patient tumors with DNA mismatch repair deficiency (dMMR) respond to immunotherapy. Low numbers of tumor infiltrating lymphocytes (TIL) remain an obstacle to effective immunotherapy for the majority of mismatch repair proficient (pMMR) CRC. dMMR CRCs have increased tumor mutational burden and show a robust inflammatory multicellular network of stromal and immune cells, including TIL, within the tumor. To investigate whether disrupting MMR in pMMR CRC could improve immune responsiveness, we designed a method of tumor-targeted gene knockdown by constructing EpCAM aptamer-linked siRNAs (called aptamer- siRNA chimeras or AsiCs) to target the MMR gene Mlh1 and convert pMMR CRC to dMMR cancers sensitive to immune checkpoint blockade. The MLH1 AsiC bound to EpCAM+ CRC cell lines and induced tumor-specific MLH1 knockdown in vitro and in vivo with no apparent toxicity. Mice bearing subcutaneous mouse pMMR CRC cell line (SL4) tumors overexpressing EpCAM treated with EpCAM AsiCs against Mlh1 showed decreased tumor growth and enhanced survival. These findings suggest that tumor-targeted knockdown of MMR genes might provide a promising strategy to expand the range of CRC tumors that respond to immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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