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Enregistrement W7112933231

Reduced expression of TLR3, TLR10 and TREM1 by human macrophages in Chronic cavitary pulmonary aspergillosis, and novel associations of VEGFA, DENND1B and PLAT

2014· article· en· W7112933231 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueResearch Explorer (The University of Manchester) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInflammation biomarkers and pathways
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCCPATLR3GeneChronic mucocutaneous candidiasisReceptorSingle-nucleotide polymorphismDiseaseGene expression
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic cavitary pulmonary aspergillosis (CCPA) is an uncommon but serious pulmonary disease of humans, with an annual mortality rate of 10–30%. It is caused by the fungus Aspergillus fumigatus. Patients are overtly immunocompetent; however, some immunogenetic defect is likely. To investigate this, we performed a genetic association study analysing biologically plausible candidate genes in 112 CCPA patients and 279 healthy controls, and investigated gene expression in monocyte-derived macrophages from patients and controls at baseline and during stimulation with A. fumigatus. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with CCPA were found in TLR1, CLEC7A (dectin-1), PLAT (n = 2), VEGFA, and DENND1B. Macrophages from CCPA patients showed low TLR3 and TLR10 expression and high TREM1 expression at baseline, as compared with macrophages from healthy subjects, with major expression differences being seen in most Toll-like receptors (TLRs) during 9 h of co-culture with A. fumigatus. The differences in baseline expression between the healthy and CCPA groups suggest roles for TLR3 and TLR10 in susceptibility to CCPA, and the association of SNPs in PLAT (n = 2), VEGFA and DENND1B supports novel roles for plasminogen activation and angiogenesis and of these genes specifically in susceptibility to CCPA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,530
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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