EGO-like complex regulates TOR (Target of Rapamycin) activity and localization in <i>Neurospora</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The TOR (Target of Rapamycin) signalling pathway is found in all eukaryotes and integrates nutrient and stress signals to control cell growth. It is well-studied in yeast and mammals but is less well understood in filamentous fungi. We previously identified TOR pathway components VTA (homologous to the vacuole-bound EGO complex of yeast) and GTR2 (homologous to Rag GTPases) as essential to maintaining circadian rhythms in the filamentous fungus Neurospora crassa . Therefore we are interested in defining the TOR pathway and its regulation in N. crassa . In yeast and mammals, TOR kinase is activated by carbon sources and amino acids. We report here that on high glucose medium, TOR is insensitive to added amino acids. On low glucose, TOR is activated by added glucose and amino acids. VTA and GTR2 knockouts block the activation of TOR by amino acids but not by glucose, identifying their function in an amino acid-sensing pathway. Live cell microscopy of KOG1 (a component of TOR complex 1) and GTR2 localizes them to punctate bodies near the vacuole. This localization is lost and the proteins are largely cytoplasmic under starvation conditions, in the presence of TOR inhibitor Torin II, and in the VTA knockout. This indicates that VTA acts as the vacuolar anchor for activated TOR complex. Co-immunoprecipitation of KOG1-FLAG and GTR2-FLAG confirms their cytoplasmic localization in VTA knockout and identifies TORC1 complex components TCO89 and LST8. These results focus attention on amino acid sensing through VTA and GTR2 as potentially regulating circadian rhythmicity in N. crassa .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».