Clinical significance of recurrently mutated genes in renal cell carcinoma: a closer look at VHL wild-type tumors
Notice bibliographique
Résumé
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), the most common subtype of kidney cancer, is known for its genomic heterogeneity and high risk of recurrence after nephrectomy. While most ccRCC tumors undergo early inactivation of the VHL tumor suppressor gene, approximately 10% are identified as VHL-wild-type (VHLwt) and may follow distinct evolutionary trajectories. Notably, the VHLwt group remains significantly underrepresented in genomic studies and is often overlooked in prognostic stratification methods. While VHL mutation alone is not associated with clinical outcomes, somatic genomic variations in other ccRCC-associated genes have been linked to prognosis. However, the clinical implications of these mutations, in the context of VHL mutation status, remain poorly understood, despite recent genomic studies that have proposed different biological underpinnings for VHLwt and VHLmut tumors.Using genomic and clinical data of 914 patients from the Cancer Genomics of the Kidney (CAGEKID) cohort, this thesis compares clinical features, mutation landscape, and survival outcomes between VHL-mutant (VHLmut, n = 720) and VHLwt (n = 194) tumors. The differences between groups were also studied, particularly through investigating the prognostic impact of co-occurring mutations, reflecting on genomic evolution in ccRCC-associated genes.The results demonstrate that the prognostic significance of mutation co-occurrence in ccRCC-associated genes is context-dependent. For example, in VHLmut tumors, particularly in stage III disease, co-occurring mutations in SETD2 and PBRM1 were significantly associated with poorer clinical outcomes. In contrast, the same mutation pattern did not show significant prognostic influence in the VHLwt group. Furthermore, co-occurring mutations in TP53 and SETD2 show an association to poor survival in patients with VHLwt only. These observations reflect on the unique biology of VHLwt ccRCC, which highlights the need to consider VHLwt separately from VHLmut tumors in predictive models.In summary, this study emphasizes the importance of stratifying patients by VHL status while investigating the prognostic potential of co-occurring mutations in ccRCC. These findings support the integration of VHL status and mutation co-occurrence patterns into future risk models and therapeutic strategies
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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