MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7115740396 · doi:10.1016/j.pld.2025.12.003

A robust phylogenomic framework supports a revised intrafamilial classification of Urticaceae

2025· article· en· W7115740396 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePlant Diversity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Species Descriptions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTen Thousand Talent Plans for Young Top-notch Talents of Yunnan ProvinceInstitute of Botany, Chinese Academy of SciencesNaturalis Biodiversity CenterKunming Institute of Botany, Chinese Academy of SciencesUniversidade Federal de PernambucoChina Scholarship CouncilUniversity of TorontoKey Research Program of Frontier Science, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of ChinaNew York Botanical Garden
Mots-clésUrticaceaePhylogenomicsPhylogenetic treeBoosting (machine learning)Supermatrix

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past decade, phylogenomics has significantly enhanced our understanding of relationships among numerous angiosperm lineages. However, comprehensive phylogenetic studies combining broad sampling of both genomic sequences and taxa within the nettle family (Urticaceae) are still lacking. Here, we reconstructed the phylogeny of Urticaceae (345 species across 89% of accepted genera) using concatenated and coalescent analyses from plastome and nuclear ribosomal DNA sequences. Different plastid datasets and tree inference methods yielded a consistent phylogenetic backbone, with 98% of nodes achieving > 90% bootstrap support — a significant improvement compared to 54% of nodes in the latest published phylogenetic study of Urticaceae. Plastid and nuclear phylogenetic relationships were largely congruent, with several exceptions that warrant further study. In the context of the updated phylogenetic relationships, we propose dividing the family into seven tribes that correspond to seven major clades or subclades, including a newly established tribe, Sarcochlamydeae stat. nov . Our phylogenetic analysis indicates that Debregeasia and Phenax are non-monophyletic. By combing morphological, molecular and distributional evidence, we describe a new genus Chiajuia gen . nov . Additionally, we propose synonymizing the following genera: Cypholophus (to Boehmeria ), Haroldiella (to Pilea ), Hemistylus , Neodistemon , Rousselia (all to Pouzolzia ), Hesperocnide (to Urtica ), and Pellionia (to Elatostema ), while recognizing Elatostematoides , Gonostegia , Leptocnide , Margarocarpus , Scepocarpus , and Sceptrocnide as distinct genera. This robust phylogenomic framework and revised classification lays a foundation for future studies on the evolution and ecology of Urticaceae. The approach applied here may also serve as an important reference for other large plant families in angiosperms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,716
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle