High CDCP1 Expression Reflects Immune and Stromal Remodeling and Oncogenic Signaling in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Background: CUB domain-containing protein 1 (CDCP1) is implicated in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) prognosis, but its relationship to the tumor microenvironment (TME) and oncogenic signaling remains incompletely defined. We hypothesized that CDCP1 expression is associated with hallmark cancer signaling pathways and transcriptionally inferred TME remodeling in PDAC. Methods: We analyzed transcriptomic and clinical data from 214 PDAC cases (The Cancer Genome Atlas (TCGA), n = 145; GSE62452, n = 69). Patients were stratified into high CDCP1 and low CDCP1 groups based on the top tertile of expression. Immune and stromal components of the TME were quantified using the xCell algorithm. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) with Hallmark gene sets was used for pathway enrichment. Results: T cells, adipocytes, and fibroblasts, suggesting an immune-excluded and stromally depleted TME. It also correlated with increased homologous recombination deficiency scores, mutation burden, and single-nucleotide variants. CDCP1 expression correlated with CDKN2A mutation but was only weakly associated with KRAS, TP53, and SMAD4 alterations. GSEA showed consistent enrichment of proliferative (E2F, MYC, G2M, p53) and protumorigenic (transforming growth factor-β, hypoxia, glycolysis) pathways in high CDCP1 tumors across both datasets. Conclusion: CDCP1 defines a transcriptionally distinct PDAC subtype characterized by immune evasion, stromal depletion, and genomic instability. These findings highlight CDCP1 as a potential therapeutic target and biomarker reflecting interplay between oncogenic signaling and the TME.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».