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Enregistrement W7116362083 · doi:10.1016/j.knosys.2025.115154

DVAE: A Dynamic Variational Autoencoder for Structured Causal Discovery with Application in Biomedical Time Series

2025· article· en· W7116362083 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueKnowledge-Based Systems · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueBayesian Modeling and Causal Inference
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésInterpretabilityAutoencoderSpurious relationshipCausal inferenceNoise (video)InferenceDeep learningSequence (biology)Time series

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Causal discovery in time-series data is critical for analyzing dynamic systems across neuroscience, economics, and biomedical signal processing. Traditional methods, such as Vector Auto-regression (VAR) and constraint-based approaches, struggle with high-dimensional dependencies, nonlinear relationships, and non-stationary dynamics. Deep learning-based models, including cMLP, cLSTM, and VAE-based approaches, aim to address these challenges but suffer from instability, over-pruning, and reliance on sparsity constraints. While cMLP provides lag-specific causal inference, its accuracy is limited, and other methods fail to explicitly capture lag-wise dependencies. This paper introduces DVAE-GC, a structured deep learning framework integrating dynamic variational inference with lag-structured recurrent MLPs (lsrMLP) to explicitly model time-lagged causal dependencies. Unlike prior methods that infer causality via weight sparsity, DVAE-GC progressively refines causal estimation, leveraging a bidirectional recurrent encoder and structured decoder. Additionally, Noise Invalidation Soft Thresholding (NIST) eliminates spurious connections, enhancing interpretability and robustness. Empirically, DVAE-GC outperforms the best baseline (CUTS) on VAR(9) by +18.3 absolute F1 points averaged over multiple noise levels, and on NetSim fMRI-20 by +8.1 absolute F1 points averaged over sequence multiple lengths; in simulated atrial rotor detection, it improves Rotational Activity Estimation Precision (RAEP) by +22.4 % over the best alternative (VAR). These are absolute-point gains, and also precision, recall, and false discovery rate (FDR) has been reported. Although evaluated in biomedical simulations, DVAE-GC applies broadly to time-series domains, including neuroscience, climate science, and financial modeling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,961
Score d'incertitude au seuil0,650

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle