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Enregistrement W7116371986 · doi:10.1016/j.exer.2025.110809

The homeobox gene, dmbx1a, is required for the development and maintenance of bipolar and photoreceptor cells in the zebrafish retina

2025· article· en· W7116371986 sur OpenAlexafffund
Amanda Miles, Jeffrey Stulberg, Vincent Tropepe

Notice bibliographique

RevueExperimental Eye Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésZebrafishRetinaHomeoboxRetinalMuller gliaCiliogenesisRetinal regenerationNeurogenesisTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinal neurogenesis at early postembryonic stages is conserved among vertebrates for its role in homeostatic tissue growth and its dysfunction in humans may partially account for diseases of retinal growth or other retinal dystrophies. However, the molecular mechanisms underlying neurogenic growth of the postembryonic retina are poorly characterized. We report a novel role for the homeobox gene dmbx1a in tissue growth, survival of differentiated cells, bipolar differentiation, and photoreceptor maintenance in the postembryonic zebrafish retina. Specifically, dmbx1a mutants exhibited reduced eye size over time, increased cell death in differentiated cells derived from progenitor cells of the central retina and ciliary marginal zone, and age- and light-dependent photoreceptor dysmorphism. By examining the early changes in the retinal transcriptome of dmbx1a mutants, we were able to determine changes in gene expression that are associated with the observed retinal defects. Among this transcriptomic data, there is evidence to suggest that dmbx1 affects known retinal-associated genes implicated in retinal degenerative conditions and ocular impairments, with a particular emphasis on ciliogenesis factors important for outer segment growth in photoreceptors. • The conserved homeobox gene Dmbx1 is required for postembryonic retinal growth in zebrafish • Dmbx1 loss of function is associated with defects in bipolar cell and photoreceptor differentiation and survival • Dmbx1 is an upstream regulator of ciliogenesis genes that are important for photoreceptor development and function

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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