MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7116657347 · doi:10.1145/3774976.3774979

Modality-Independent nnU-Net-Based Segmentation of Psoas Muscle and Vertebral Bodies in CT and MRI for Spinal Metastases Patients Undergoing SBRT

2025· article· W7116657347 sur OpenAlexaff
Yessica Castano Sainz, Cari Whyne, Michael Hardisty

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langue
DomaineEngineering
ThématiqueMedical Imaging and Analysis
Établissements canadiensYork UniversitySunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationVertebral bodyMagnetic resonance imagingPsoas MusclesRadiation therapyRisk stratification

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Musculoskeletal (MSK) imaging biomarkers may support risk stratification and longitudinal monitoring in spinal cancer patients undergoing stereotactic body radiotherapy (SBRT), particularly those at risk of osteosarcopenia—a condition involving concurrent loss of bone and muscle mass. While CT-based biomarkers are well established, MRI provides superior soft-tissue contrast without ionizing radiation, making it an attractive modality for longitudinal assessments. In this work, we leverage aligned CT–MRI pairs as a weakly supervised framework to train nnU-Net models for automatic segmentation of the psoas muscle and vertebral bodies in MRI. CT-derived segmentations were propagated to MRI volumes, enabling model training without manual MRI annotations. Using 5-fold crossvalidation and nnU-Net postprocessing, the combined psoas model achieved a mean Dice score of 0.90, and the best vertebral body model achieved 0.82 for L1–L5. These results support the feasibility of radiation-free MSK biomarker extraction from MRI in SBRT populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,838
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetMedical Imaging and AnalysisTravaux en français237 207