Unexpected High Frequency of <i>Pneumocystis jirovecii</i> Pneumonia at SCID Diagnosis
Notice bibliographique
Résumé
Patients with severe combined immunodeficiency (SCID) have a predisposition to opportunistic infections, including Pneumocystis jirovecii. Previous reports based on traditional microscopy and culture estimate the prevalence of Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP) at diagnosis of SCID around 20%. Polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of PJP in bronchoalveolar lavage (BAL) demonstrates high sensitivity when compared to traditional culture methods. We present three cases of SCID who underwent routinely Pneumocystis jirovecii PCR at the time of SCID diagnosis in the past year, during which PCR testing for Pneumocystis jirovecii became routinely available at our institution. All patients underwent a chest computed tomography (CT) at the time of diagnosis. Imaging findings included ground-glass opacities in two patients, consolidation in two patients, and atelectasis in two patients. One patient had no respiratory symptoms, oxygen requirement, or clinical evidence of pulmonary involvement prior to the CT scan. However, imaging revealed ground-glass opacities and consolidation. During the BAL procedure, the patient experienced clinical deterioration, including a respiratory arrest, and required mechanical ventilation. All three SCID patients tested positive for Pneumocystis jirovecii by PCR at the time of diagnosis. Each received empirical treatment with co-trimoxazole prior to the availability of PCR results. Only qualitative PCR was available, which may lead to some false-positive results. However, in the context of SCID patients with consistent clinical or radiological findings, infection was presumed. With the advent of more sensitive and specific diagnostic tools such as PCR for Pneumocystis jirovecii, the true incidence of this infection at the time of SCID diagnosis may be higher than previously recognized, even among asymptomatic patients. We recommend routine PCR-based screening for Pneumocystis jirovecii in all newly diagnosed SCID patients, when available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».