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Enregistrement W7116698340 · doi:10.70962/lasid2025abstract.95

Characterizing SCID in Bogota: A Single-Center Experience

2025· article· en· W7116698340 sur OpenAlexaff
Santiago Moreno-Terreros, Óscar Ramírez, Juan Francisco López, Milena Villamil-Osorio, Marcela Estupiñán, Mauricio Chaparro, Laura Niño, Lina Castano-Jaramillo, Natalia Female Vélez-Tirado

Notice bibliographique

RevueJournal of Human Immunity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMisericordia Community Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSevere combined immunodeficiencyHematopoietic stem cell transplantationImmunodeficiencyConsanguinityTransplantationImmune systemNewborn screeningWiskott–Aldrich syndrome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe combined immunodeficiency (SCID) is a group of inborn errors of immunity that severely impair the immune system and lead to high susceptibility to infections. We present the cases of nine patients with SCID diagnosed at a pediatric referral center in Bogotá. Of the nine patients, seven (78%) were female and two (22%) were migrants. Consanguinity was reported in two cases, and one involved endogamy. The median age at diagnosis was 4 months and the median age at first infection was 2 months. Bacterial infections were documented in five patients, mostly due to Gram-negative organisms. Seven patients (78%) had BCGitis, three progressed to BCGosis. IgA and IgM levels were decreased in seven patients; total IgE was <15 IU/mL in all. IgG levels were low in all but one patient, reflecting maternal antibodies. Lymphoproliferative responses were severely decreased when tested. Seven cases were classified as “classical” SCID: five due to defects in IL2RG, IL7R, RAG1, RAG2, DCLRE1C, and ADA; two due to compound heterozygosity in RAG2 (one of whom presented with maternal T cell engraftment); and one secondary to a complete 22q11.2 deletion with athymia. There was one patient with leaky SCID secondary to ORAI1 mutations. All patients received immunoglobulin replacement, trimethoprim/sulfamethoxazole, fluconazole, and four-drug therapy for BCG (Bacillus Calmette–Guerin)-related disease. Acyclovir and palivizumab prophylaxis were given to 56% of patients. Two patients died before hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) due to severe infections and one patient with 22q11.2 deletion was not a HSCT candidate. Colombia currently lacks a newborn screening program for SCID, leading to delayed diagnoses typically after severe infections during early infancy, frequently with organ involvement that negatively impacts survival. This case series highlights the clinical complexity and diagnostic challenges of SCID in a resource-limited setting, emphasizing the urgent need to guide public health policies for early detection and other strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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