The Superoxide dismutase (SOD) Gene Family in Litchi (Litchi chinensis Sonn.): Identification, Classification, and Expression Responses in Leaves Under Abiotic Stresses
Notice bibliographique
Résumé
Superoxide dismutase (SOD) serves as a critical enzyme that is involved in plant development and abiotic stresses by effectively detoxifying reactive oxygen species (ROS). Though the SOD gene family has been reported across various plant species, its specific members and functional roles in litchi (Litchi chinensis Sonn.) remain poorly understood. In this study, a total of seven SOD (christened LcSOD) genes were identified from the litchi genome and classified into three groups across six chromosomes. Notably, genes from the same evolutionary branch had more similar structures and motif distributions. The LcSOD genes were confirmed to have a stronger collinearity with dicotyledons than with monocotyledons. Cis-acting elements analysis indicated that the LcSOD gene family was deeply involved in orchestrating growth, development, and responses to multiple phytohormones and diverse stresses. Expression patterns of the LcSOD genes across different tissues revealed universal and specific expressions. In leaves, expression levels of the LcSOD genes were induced by cold, heat, drought, and salt stresses, and transcript levels correlated positively with concomitant changes in key physiological parameters under the same conditions. In addition, the LcSOD genes were characterized for their physicochemical properties, subcellular localizations, secondary and tertiary structures, gene ontology (GO) annotations, and protein-protein interactions. Our findings offer comprehensive insights into the LcSOD gene family, enriching genetic resources. They provide a framework for functional characterization and the development of stress-resistant cultivars, driving both basic research and applied breeding programs in litchi.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».