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Enregistrement W7116778185 · doi:10.1038/s41598-025-30734-7

Bridging pleiotropic mechanisms in leprosy type-1 reactions and neurodegenerative diseases

2025· article· en· W7116778185 sur OpenAlexafffund
Vinicius M. Fava, Jônatas Perico, Marianna Orlova, Monica Dallmann-Sauer, Yong Zhong Xu, Nguyen Van Thuc, Vu Hong Thai, Andréa Faria Fernandes Belone, Ana Carla P. Latini, Erwin Schurr

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLeprosy Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesAlliance de recherche numérique du CanadaLeprosy Research InitiativeMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésGeneDiseasePhenotypeAmyotrophic lateral sclerosisCRISPRLeprosyEpistasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Leprosy is an infectious disease of the skin and peripheral nervous system. Sudden episodes of hyperinflammation, known as Type 1 Reactions (T1R), are a main contributor to permanent nerve damage in leprosy. The genetic component associated with the neuro-inflammatory phenotype of T1R displays pleiotropic effects with Parkinson’s disease (PD). In this study, we explored the genetic overlap between PD and T1R and expanded the evaluation of pleiotropic effects between T1R and other neurodegenerative disorders. We replicated the association of PD-linked rare variants in PRKN with T1R in Vietnamese leprosy patients. Analysis of 24 PD associated-genes revealed compound effects between rare protein-altering variants and T1R in the interacting genes PRKN/PINK1 ( P = 2.7 –05 ; OR = 4.0) and a combination of rare/low frequency variants in the LRRK2/GAK pair ( P = 6.7 –05 ; OR = 0.54). These findings validated a genetic overlap between T1R and PD with two distinct axes, one of shared risk via PRKN/PINK1 and a second of antagonistic pleiotropic via LRRK2/GAK . When testing an additional 94 genes associated with neurodegenerative diseases we identified variants in the amyotrophic lateral sclerosis disease-linked gene TBK1 associated with T1R ( P = 0.004; OR = 12.9). Our results highlight shared biological processes between leprosy and neurodegenerative diseases, which may indicate candidate drugs for repurposing to improve T1R management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,271

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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