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Enregistrement W7116908933 · doi:10.1002/alz70855_097892

Developing a transcriptomic atlas of Alzheimer's Disease progression in the Tg2576 mouse model using single‐cell RNA‐sequencing technology

2025· article· en· W7116908933 sur OpenAlexaff
Kelly Marie Johns, Giorgia Caspani, Wing Yan Leung, Chaahat S. B. Singh, Maria‐Elizabeth Baeva, Cheryl G. Pfeifer, Wilfred A. Jefferies

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeDiseaseAngiogenesisAtlas (anatomy)Neovascularization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder marked by cognitive decline, ultimately leading to dementia and death. While the amyloid hypothesis has historically guided AD research, emerging evidence suggests alternative mechanisms, including vascular dysfunction. Angiogenesis, the formation of new blood vessels, is increasingly implicated in early AD pathology, yet transcriptomic insights remain limited. To address this gap, we generated the first single-cell transcriptomic profile of AD progression in a mouse model, aiming to identify novel molecular mechanisms and potential therapeutic targets. METHOD: We analyzed brain tissue from Tg2576 AD model and control mice (N = 28, both sexes) at six developmental timepoints. Single-cell RNA sequencing was performed using 10X Genomics technology, followed by pathway analysis to identify transcriptional changes associated with AD pathology. RESULT: Pathway enrichment analysis in 6- and 9-month-old AD mice revealed significant upregulation of angiogenesis (p = 3.37E-02), vasculature development (p = 3.71E-02), and amyloid-beta formation (p = 1.49E-02). CONCLUSION: These findings provide a single-cell resolution view of AD-related transcriptional changes, supporting a 'vascular angiogenesis model' of AD. Disruptions in blood-brain barrier integrity due to aberrant neoangiogenesis may drive amyloid-beta accumulation, contributing to disease progression. This study underscores the therapeutic potential of targeting vascular dysfunction in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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