Transcription, Alternative Splicing, and Post-Translational Regulation of CaLOXs in the Dynamic Regulation of Jasmonate Levels in Wounded Pepper Leaves
Notice bibliographique
Résumé
In response to stresses, jasmonates increase rapidly, leading to plant resistance against necrotrophic pathogens and chewing insect herbivores. Jasmonate biosynthesis is regulated at many levels, including transcriptionally, through alternative splicing, and the phosphorylation of the 13S-lipoxygenase (LOX) that catalyzes an early step in jasmonate biosynthesis. In pepper, transcriptomic analysis of a foliar wounding time course was conducted to deepen our understanding of these regulatory mechanisms. All four CaLOXs are constitutively expressed. CaLOX2, which encodes an enzyme with a Ser in a predicted regulatory phosphosite, shows a rapid but short-lived increase in wound-induced expression. In contrast, CaLOX7, which encodes a protein with a non-phosphorylatable Ala at the phosphosite, shows higher wound-induced expression at 6 h. As well, at this timepoint, there is a predicted increase in exon 4 retention in CaLOX8 transcripts in wounded plants. ChimeraX protein modeling predicts that the retention of exon 4 may negatively affect enzyme activity, possibly by blocking access to the enzyme’s active site. The transcription, alternative splicing, and post-translational regulation of CaLOX enzymes support the dynamic fluctuations observed in the jasmonates, which increase rapidly upon wounding and return to basal levels at 6 h post-stress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».