Saliva Sampling and Testing Strategies for Screening AD Biomarkers Using a Portable Antibody Functionalized Bioanalyzer Platform
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Saliva collection has been explored for non-invasive AD biomarker testing in several studies (Kirmess et al.,2021, De Meyer et al.,2020), however, challenges persist in maintaining consistent sampling and reliable benchmarking for the low salivary Aß42 concentration in healthy controls (0.6-66.1pg/ml; Agnello et al.,2024, Sabbagh et al.,2018). We share preliminary outcomes on using novel saliva collection kit prototypes from DNA Genotek Inc.(Ottawa) for clinical trial deployment of our patent-pending bioanalyzer platform. METHOD: Saliva was collected from healthy control (established using brain MRI at the IMHR, Royal Hospital, Ottawa) using two collection kit prototypes (Drool Saliva Collection(DSC) and Sponge-tip Saliva Collection(SSC)). Collected samples were spiked to 10 µg/ml of Aß42 and a dilution series (100ng/mL-100fg/mL) was created using the supernatant. Figure 1(A) shows the portable bioanalyzer (Ab-OEGFET; Johri et al.,2024, Johri et al.,2025) used for saliva testing. RESULT: The Ab-OEGFET sensor(bioanalyzer) predicts Aß42 concentration through an inversely correlated output current(ID-SAT). The output (Figure 1B) shows current modulation with gate bias (VSG), and Figure 1(C) shows the current modulation for different concentrations of Aß42(VSG=2.4V). The human saliva supernatant(HSN) collected via DSC kit prototype was tested first without Aß42 spiking, and then by spiking with 10 µg/mL Aß42, followed by serial dilution. The non-spiked HSN showed a predictable drop in current with increase in overall protein baseline concentration of saliva, whereas Aß42 spiked HSN showed a clear inflection ∼1ng/ml spiking level (Figure 2). In another experiment (Figure 3), HSN collected from DSC and SSC prototypes were spiked with 10 µg/ml Aß42. The DSC prototype represented inflection in sensing range ∼1ng/ml of spiked protein and the SSC prototype appeared to have inflection point ∼10 ng/ml of spiked protein, showing variation in overall protein baselines from the two collection strategies. As evident, DSC prototype samples had higher background protein concentration whereas samples from the SSC prototype had comparatively higher concentration of dilution buffer. CONCLUSION: The saliva sampling prototype testing with bioanalyzer platform was conducted to verify the protein stability and platform capability prior to deployment in an AD dementia clinical trial in Ottawa. The team will now proceed with testing saliva samples from patients with different stages of AD pathology as established using amyloid PET scans (IMHR, Ottawa).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».