Numerical Variability of functional MRI Graph Measures
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Network neuroscience provides a powerful framework for studying the mechanisms underlying brain-related diseases. As analyses become increasingly computational, ensuring their numerical reliability has become a critical challenge. Small perturbations introduced during processing can propagate through complex pipelines, leading to variability in outcomes and raising concerns about the reproducibility of reported findings. Addressing this issue requires systematic evaluation of pipeline stability to ensure results remain within acceptable numerical limits. While the numerical variability of structural imaging workflows has been investigated, with findings ranging from negligible to substantial, functional MRI (fMRI) pipelines and their derived graph measures remain underexplored. Without rigorous stability assessment, conclusions drawn from these measures may remain uncertain. We systematically evaluated the numerical variability of graph measures of functional connectivity derived from the widely-used fMRIPrep pipeline and compared it to population variability. The resulting Numerical-Population Variability Ratio (NPVR) values typically ranged from 0.1 to 0.2 for most graph metrics, indicating a measurable influence of numerical variability on network-derived outcomes. NPVR values varied across brain regions, thresholding choices, and confound regression strategies. These findings highlight numerical variability as an important factor in functional network studies, particularly when examining subtle effects or working with small sample sizes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,076 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».