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Enregistrement W7117142478 · doi:10.64898/2025.12.22.696109

Identification and Functional Characterization of <i>Isoflavone Synthase</i> Gene Family in Pea ( <i>Pisum sativum</i> ): The Entry Point to Pisatin Biosynthesis

2025· article· W7117142478 sur OpenAlexafffund
Muhammad Sufyan Tahir, Kuflom Kuflu, Nishat S. Islam, Tim Mcdowell, Sangeeta Dhaubhadel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensWestern UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaAlberta Pulse Growers CommissionAgriculture Funding ConsortiumWestern Grains Research Foundation
Mots-clésIsoflavonoidGenePhytoalexinGene familyCytochrome P450NaringeninMonooxygenaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Isoflavone synthase (IFS), a cytochrome P450 monooxygenase of the CYP93C subfamily, catalyzes the conversion of flavanones into isoflavones, the first committed step in the biosynthesis of isoflavonoid phytoalexins. In pea ( Pisum sativum L.), the phytoalexin pisatin plays a pivotal role in defense against pathogens. However, the molecular basis underlying IFS function in pea remains poorly understood. In this study, we performed a comprehensive genome-wide identification and characterization of IFS genes in pea. Three IFS candidates, PsIFS7A , PsIFS7B , and PsIFS7C , were identified that reside on chromosome 7, each harboring all conserved cytochrome P450 signature motifs. PsIFS genes exhibited predominant expression in root tissue, with transcript levels induced rapidly upon Aphanomyces euteiches infection. Enzymatic assays confirmed their catalytic activity in converting the flavanones naringenin and liquiritigenin into the isoflavones genistein and daidzein, respectively, both in vitro and in planta systems. Furthermore, all three PsIFS genes were found in close proximity to quantitative trait loci (QTL) associated with Aphanomyces root rot resistance. Together, these findings provide novel insights into the IFS gene family in pea and lay a foundation for metabolic engineering or molecular breeding strategies to enhance disease resistance through targeted modulation of pisatin biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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