YfgH is a transmembrane glycine-zipper containing lipoprotein that stabilizes excess cardiolipin and outer membrane proteins during envelope stress
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The outer membrane (OM) of Escherichia coli is an essential, asymmetric bilayer composed of lipopolysaccharide and phospholipids that protects cells from environmental stress. While several systems maintain OM integrity during stress, the roles of many outer membrane lipoproteins are less well characterized. Here, we identify YfgH, a glycine-zipper domain containing lipoprotein, as a novel OM-stabilizing factor that functions distinctly from the previously studied SlyB. Deletion of yfgH increases sensitivity to detergents and metal chelators, enhances OM permeability, and leads to global loss of OM proteins under stress. YfgH is essential for survival during CRISPR interference-mediated depletion of OM biogenesis genes, and its overexpression rescues these phenotypes. AlphaFold modeling predicts YfgH forms oligomeric ring-like structures similar to SlyB, but genetic suppressor screens indicate distinct mechanisms: clsA (cardiolipin synthase) mutations suppress yfgH deletion, while slyB suppressors map to the Mla lipid transport pathway. Biochemical analyses reveal YfgH interacts with multiple OM proteins, especially under stress. Together these findings suggest YfgH functions by stabilizing cardiolipin-rich nanodomains, representing a novel response to OM stress. This work expands our understanding of glycine-zipper lipoproteins as stress-specific membrane stabilizers and highlights the critical role of YfgH in preserving OM integrity during envelope perturbation. Importance The bacterial outer membrane is essential for survival in harsh environments, yet how Gram-negative cells maintain its stability under stress remains less understood. We identify YfgH, a previously uncharacterized outer membrane lipoprotein, as a key factor that preserves membrane integrity during envelope stress. Our findings show that YfgH stabilizes cardiolipin-rich nanodomains and protects outer membrane proteins when biogenesis pathways are compromised. This work reveals a new mechanism of outer membrane maintenance and expands the functional repertoire of glycine zipper– containing lipoproteins, highlighting a broader family of stress-specific membrane stabilizers that may be conserved across Gram-negative bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».