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Enregistrement W7117254742 · doi:10.1038/s41598-025-29063-6

Identification of dysregulated gene clusters and pathways driving ocular surface squamous neoplasia progression

2025· article· en· W7117254742 sur OpenAlexaff
Kartik Goel, Shruti Rathore, Prisha Warikoo, Mehak Sapra, Shirali Gokharu, Rajesh Kumar, Dheerendra Kumar, Arpan Gandhi, Virender Singh Sangwan, Sima Das, Anil Tiwari

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOcular Oncology and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesVelux Stiftung
Mots-clésTranscriptomeGeneIdentification (biology)Immune systemSignal transductionCell cycleImmune escapeCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ocular Surface Squamous Neoplasia (OSSN) represents a spectrum of ocular malignancies that threaten vision and ocular integrity. To unravel the molecular mechanisms underlying OSSN progression, we conducted RNA-sequencing on conjunctival tissues from healthy individuals and patients with OSSN. Our analysis revealed marked alterations in the expression of genes implicated in inflammation, immune dysregulation, cell cycle regulation, and cellular stress responses. Notably, genes such as TP53, CXCL9, CXCL11, IL6, TNFα, MMP7, MMP9, GSTM1, IFNα, and IL1β showed significant dysregulation in OSSN samples compared to controls. Pathway enrichment analysis highlighted the activation of Interferon-α, Interferon-γ, and IL6/JAK-STAT3 signaling, alongside pathways regulating inflammatory response, p53 signaling, G2M checkpoint, and apical surface integrity. Together, these findings indicate that OSSN is characterized by a pro-inflammatory and proliferative transcriptomic profile driven by chronic immune signaling and disrupted cell cycle control. These findings provide novel insights into the transcriptional landscape of OSSN and identify key pathways that may be targeted for improved diagnosis and therapy. The molecular insights provided by this study can potentially inform stratified management approaches and aid in the development of novel treatments for this challenging ocular surface malignancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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