Glioblastoma stem cells show transcriptionally correlated spatial organization
Notice bibliographique
Résumé
DATASET_FINAL A. original_phase_contrast_images This compressed file contains all the images compressed as .mp4 videos containing images used in this study. samples : 15 GBM, IDH-wt GSCs Conditions : Grown in neural stem cell media with growth factors. Each video is a time-series of images from a single well. B. datasets_images_ilastik_training_and_manuscript_figures fig_original_images Contains the original uncropped images for figure 1 and supplementary fig 1. These are phase contrast images. A reference image with the original scale bar is provided. Ilastik_training_images_with_masks This folder contains the training images used for each sample to generate the masks for cellprofiler image analysis. Training and mask generation was carried out using ilastik. C. manuscript_analysis_data Files used in analysis Cellprofiler image feature output for each image GSVA scores for 111 gene signatures from 15 matched bulk gene expression sample DATASET_VALIDATION A. original_videos_validation This compressed file contains all the images compressed as .mp4 videos containing the validation images used in this study. samples : 4 GBM-derived GSCs Conditions : Grown in neural stem cell media with growth factors. Each video is a time-series of images from a single well. B. ilastik_masks_validation Ilastik_training_images_with_masks This folder contains the training images used for each sample to generate the masks for cellprofiler image analysis. Training and mask generation was carried out using ilastik.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,040 | 0,033 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».