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Enregistrement W7117304656 · doi:10.1007/s11557-025-02099-8

Puccinia tritici-golanensis, a new wheat leaf rust pathogen from Yonatan region of the Golan Heights, Puccinia tritici-duri and Puccinia triticina typified, and their phylogenetic relationships

2025· article· en· W7117304656 sur OpenAlexafffund
Sarah Hambleton, Julie Carey, M. Liu, Les J. Szabo, J. A. Kolmer, J. Manisterski, Pnina Ben-Yehuda, Tamar Eilam

Notice bibliographique

RevueMycological Progress · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaMuséum National d'Histoire NaturelleTel Aviv UniversityPurdue University
Mots-clésPhylogenetic treeSensuRibosomal DNAInternal transcribed spacerTaxonTaxonomy (biology)PucciniaPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The fungi causing diseases of cereal crops and other grasses, known as the brown leaf rusts, have historically been classified in the Puccinia recondita (sensu lato) species complex. Despite a long history of taxonomic effort, the recognition of the many included discrete taxa has been challenged due to overlapping morphological characters and primary grass hosts. More recent studies employing DNA sequence analyses identified multiple phylogenetic lineages in the complex, with two corresponding to species important to agricultural production, Puccinia triticina and P. recondita sensu stricto, on wheat and rye respectively. In this study, a second wheat-associated species, Puccinia tritici-duri , as yet known only from the Mediterranean region, and a new species recently discovered in the Golan Heights on wild emmer wheat, were examined and compared with P. triticina . We conducted detailed morphological examinations of telial and uredinial stages, DNA sequence analyses of the ribosomal DNA internal transcribed spacer region and elongation factor 1-α, and greenhouse inoculation experiments using a broad selection of Triticum and Aegilops telial hosts. The results demonstrated that the three wheat-associated species are distinct, placed in three unrelated lineages within the P. recondita complex. They confirm an overlap in host associations, which varied depending on species or cultivar. Based on the combined evidence, we formally propose the new species as Puccinia tritici-golanensis and provide comprehensive notes for the other two species, supported by descriptions and illustrations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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